- 2006-2011 : Projet Européen FP6 The nitrogen cycle and its influence on the European greenhouse gas balance (NitroEurope IP) (coord. M. Sutton, Edinburgh ; coord. Volet Prairies J-F. Soussana, INRAE-UREP) - http://www.nitroeurope.eu/
- 2007-2011 : Projet Européen FP7 Infrastructure for the Measurement of the Europeen Carbon Cycle IMECC (coord. P. Ciais LSCE, Saclay). http://imecc.ipsl.jussieu.fr/index.html
- 2008-2010 : Projet Européen "EGIDE" (PROCOPE) Carbon flow and soil organic matter as influenced by plant species composition (Coord: A. Chabbi, INRAE Lusignan).
- 2006-2009 : Projet Régional - Impacts des périodes de sécheresse sur la nature et la dynamique de la matière organique du sol: conséquences sur la qualité des eaux et sur le cycle du carbone dans la prairie temporaire (Coord. A. Chabbi, INRAE Lusignan).
- 2005-2008 : Projet National ANR-05-ECCO-011 - Processus de stabilisation des matières organiques dans les horizons profonds des sols sous culture ou prairie (Coord. C. Rumpel, CNRS Bioemco et A. Chabbi, INRAE Lusignan).
- 2005-2008 : Projet National ANR-ECCO-stockage de carbone dans le sol et le rôle des interactions microbiennes pour le turnover de la MO du sol (Coord. S Fontaine, INRAE-UREP).
- 2004-2008 : Projet Européen FP6 CarboEurope IP - Assessment of the European Terrestrial Carbon Balance (coord. E.D. Schulze, Jena ; coord. Volet Prairies J-F. Soussana INRAE-UREP). http://www.carboeurope.org/
- 2006-2008 : Projet national ANR Diversité biologique et fonctionnement des écosystèmes : Interpréter et évaluer des expériences clés en prairie grâce à une modélisation mécaniste (Coord. J-F Soussana, INRAE UREP).
- 2006-2008 : Projet national ANR/ECCO Structure, diversité et fonctionnement: des clés multi-échelles pour la gestion des prairies permanentes. Coord. par P. Cruz, INRAE-AGIR.
- 2008-2010 : Projet Européen FP7 An European Research Infrastructure for the Analysis and Experimentation on Ecosystems (Design study) (Coord. G. Lemaire, INRAE Lusignan).
- 2006-2009 : Nature et réactivité des matières organiques dissoutes dans les agro-écosystèmes: effet de l’introduction de prairies temporaires sur la lixiviation de pesticides utilisés sur les précédents culturaux (Coord. JP. Croué, ESIP, Poitiers ; et A. Chabbi, INRAE Lusignan).
- 2004-2007 : Projet National ADEME-GESSOL Couplage de la dynamique des communautés microbiennes du Sol, des Matières Organiques du Sol et des FLUX de carbone et d’azote dans les sols (COSMOS FLUX) : effets des modifications des pratiques agricoles et impacts environnementaux (Coord. X. Le Roux et S. Recous, INRAE).